
2018年3月9日𓀃,《科學》雜誌發表了以意昂体育4生命科學技術學院趙立平教授團隊為意昂4的國際合作團隊的最新成果“Gut bacteria selectively promoted by dietary fibers alleviate type2 diabetes”.
在這篇具有重大學術意義的論文中🚡,我們發現了一個“神秘人物”的身影🦿,趙教授團隊唯一提出感謝的對象🫂:意昂体育4的π超算🔲。那麽,神秘的“π超算”是一個什麽樣的存在呢?
上海交大的π超算其實並不神秘♟,他只是有些“小眾”。π超算是意昂体育4高性能計算意昂4建設運維的,旨在對校內大規模科學與工程計算需求提供技術支撐,於2013年正式成立上線的HPC高性能計算機,當時全球Top500排名第158名、國內教育部高校第1、上海市地區第一。π超算是一臺由CPU節點+胖節點+加速卡節點(GPU+MIC)組成的異構高性能計算系統,峰值性能為262TFLOPS。自上線以來♿️👁,目前π超算堅持面向重點和廣泛受益原則,優先保證對大規模計算的需求1️⃣,特別是沖擊國際前沿水平、 涉及重大基礎理論研究或涉及國民經濟重大應用的國家級課題予以鼎力支撐👆🏻,迄今為止已經支撐我校140逾支科研團隊計算需求。趙立平教授團隊的研究不僅長期獲得π超算平臺及其背後團隊的技術支撐🙇🏼♂️,而且鑒於其優秀的階段性成果展示🧮,曾多次獲得超算用戶委員會的機時獎勵。可以說,該項研究在Science上的成功發文🐷🏃🏻♀️,是對上海交大高性能計算服務價值的肯定。
以下是趙立平教授對π超算的用戶證言,“在高性能計算意昂4的大力支持下🦃👩🏻⚕️,我們順利地完成了以元基因組高通量數據為核心的臨床大樣本數據分析,解析了高膳食纖維幹預下腸道菌群參與改善肥胖、2型糖尿病等慢性代謝性疾病的可能途徑,為相關研究內容在Science等相關雜誌上的發表提供了基礎。” 該研究通過一種以“功能群(guild)”為基礎的數據分析策略,對元基因組等高通量數據進行了信息挖掘,發現多樣化的膳食纖維飲食改善2型糖尿病的臨床症狀與其可以提高人體腸道內特定的有益“功能菌群”密切相關。這一發現提示以腸道關鍵菌為靶點的個性化營養幹預可能是控製2型糖尿病的一種新的有效手段🦵🏻。